Bioinformática
Área Científica: Ciências Informáticas
Ano: 1º
Semestre: 1
Créditos: 6 ECTS
Horas de contacto:
Objectivos/Competências adquiridas:
- Desenvolver estratégias para a abordagem in sílico de informação biológica.
- Adquirir competências a nível da implementação e reengenharia de software e bases de dados de índole biológica.
- Utilizar ferramentas bioinformáticas, disponíveis, para a análise e anotações de informação biológica.
- Utilizar métodos estatísticos capazes de analisar grandes quantidades de dados biológicos e predizer estruturas e funções de biomoléculas.
- Utilização da bioinformática na optimização de produções biotecnológicas.
- Dominar ferramentas bioinformáticas que permitam modelação e simulação de proteínas para modificações funcionais.
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Conteúdo da unidade curricular:
Tecnologia de bases de dados e obtenção de dados biológicos.
Bases de Dados Biológicas (ADN, ARN e proteínas).
Bioinformática na WWW.
Ferramentas de software para análise e predição de sequências biológicas.
Princípios de programação orientada à computação biológicas (Perl).
Análise de sequências: padrões, alinhamentos, perfis, motivos.
Modelos estatísticos e probabilísticos para análise e predição de genes.
- Modelos de Markov;
- Programação Dinâmica;
Data Mining – Processo de extracção de conhecimento.
Optimização – Redes Neuronais, CBR e Algoritmos Genéticos.
Integração de Bases de Dados e Serviços Bionformáticos.
Redes e computação de alto rendimento (computação paralela).
Microarrays.
Bioinformática e Filogenia.
Modelação e simulação computacional da estrutura e função das proteínas.
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Bibliografia recomendada:
An Introduction to Bioinformatics Algorithms (Computational Molecular Biology), Neil C. Jones and Pavel A. Pevzner, 2004
Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis, David W. Mount, 2004
Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins, Third Edition by Andreas D. Baxevanis and B. F. Francis Ouellette, 2004
Biological Sequence Analysis : Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids by Richard Durbin, Sean R. Eddy, Anders Krogh, and Graeme Mitchison, 2004
Beginning Perl for Bioinformatics by James Tisdall , 2001.
Structural Bioinformatics by Philip E. Bourne and Helge Weissig, 2003.
T = teóricas; TP = teórico-práticas; PL = ensino prático e laboratorial; TC = trabalho de campo; S = seminário; E = estágio; OT = orientação tutória;
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